NIH再次设立funding支持新一代纳米技术的测序研究

喜欢喝冰茶

; t# b9 o7 R3 M5 g. n9 I
9 Z& b5 ?; X' G' q* E6 j8 p' ^NIH/NHGRI准备出19Million去支持nano技术来降低NGS／3GS，maybe 4GS。

4 y( ]5 L0 ]9 ?( E$ b! {http://www.bioresearchonline.com ... amp;source=nl:35056
# n6 v1 f* a: K5 a; {
2 O' i% @- `, n7 u现NIH director好像是原来的NHGRI的director，同时也是Human Genome Project，一个所谓的international collaborative project的leader。

, C( k" B( h) E; S! F
3 z2 R+ x. F6 N& i4 S& R& l5 Z* _
Sequencing的成本在最近的四、五年中，绝对是dramatically的下降。在可以预见的将来，personal genome已经不再是梦想，而且将其发展为新生儿的标准检测之一也并非不可能。事实上，现在10k左右的价格，对癌症病人的医疗开销相比而言也不算什么。这个潜在市场的效益应该还是不小的，不知道会不会使美国health care方面的开支在GDP的比例从1／5变成一个quarter。
( [0 I* F5 Y/ f+ M  o( ^% w
6 ^7 N' S$ d# [) s9 m6 h至于用处，在没有足够clinical patients' genomes的情况下，molecular diagnosis的全面使用还不是很靠谱，毕竟microarray探测不出新的东西，虽然深度分析加上对现有知识的总结能够发现一些东西。换句话说，FDA／NIH极力推动的personalized medicine还有很大的挑战。但即使如此，这方面的研究已经对癌症的诊断有了贡献。像breast cancer中的几个重要的biomarkers，还有就是几乎成为每次必讲的Nicholas Volker（US clinics quietly embrace whole-genome sequencing），都已经显示出来这个方面的研究潜在的巨大应用前景。而癌症的早期发现，对于治疗有决定性的作用，像breast cancer和prostate cancer的早期发现的治癒率或者控制率几乎将近80％，而到晚期，基本上就靠人品了。
; U$ Z, a- P% ^4 \( l
在令人沮丧的Pathway Genomics－Walgreen－FDA事件（http://www.cnn.com/2010/HEALTH/05/12/genetic.testing.walgreens/）两年后，上个月初，这个领域的著名公司之一，23&Me向FDA递交了510（k）（https://www.23andme.com/about/press/fda_application/）去推动FDA在这个领域的regulation的制定，照23&Me的说法，这是工业界第一次推动政府监管机构制定相关准则的尝试。

当然，这项工作涉及到的不仅是技术上的问题，还有法律，政府监管和医学道德的问题，有很多地方都没有明确的规章制度，虽然早在08年的时候，国会就已经通过了GINA（the Genetic Information Nondiscrimination Act）法案。在国内，SFDA也没有统一的规章制度，据说各地的SFDA拥有相对大的灵活性，事实上，已经有一些海归背景的公司和机构在搞这类东西，但无论是资金还是技术力量和美国还有很大的差距。有意思的是，在这个领域比较兴盛的地方，基本上就是boston地区和南／北加地区，特别是北加地区的公司大部分都集中于硅谷，和google等等为邻。
! o" A; C; v, u
在众多的NGS／3GS公司中，Complete genomics以提供一个完整solution成为亮点之一。其特别的技术以及深度的分析，至少现在对临床方面会是一个比较好的选择。当然如果成本能更快的降低，加上拥有中国中央和地方政府支持的BGI的强力跟进，希望市场上不再是Life旗下的PGM如日中天的声势。BGI的加入，是否会和Hitachi有千丝万缕关系的life在这行形成所谓的中日之争，我们将拭目以待。