基于“拔河”的HT Chip

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最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
: ]- n( d3 s& R7 h8 @0 u
事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。

" X7 ^5 W( X3 o+ s/ q某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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$ Z( w6 T$ \2 E& l4 O. K

martian 发表于 2012-9-15 02:37
0 k3 {& Q3 G; W. n) G  n$ v5 E, V有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm

" [$ C1 ^, m  ^( E0 P% pMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
6 W7 o' s; a/ w: q7 I/ c$ ]4 m这个似乎全文是免费的。
2 H3 H1 W; l3 V8 H
9 L: W! c: H8 |: tBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
* z+ K: o/ q" z( ~0 [! x# Y5 x不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
  y: E4 @, v3 u& I/ P9 I

: O. D1 b4 N0 y# H& L

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隧道 发表于 2012-9-25 02:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
4 O' l5 i  M2 F. e: V  M/ L5 ~$ X  @0 `不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

+ f! d( }+ Q7 }. M看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
9 R) Q+ N  s  j8 F( F
慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。