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[科技前沿] 基于“拔河”的HT Chip

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楼主
发表于 2012-9-14 22:55:13 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 & r6 _5 u9 x- B  G5 f8 ^( \$ x$ q
% q% w; K1 M) Q) [! J& R) S
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度,是现在热炒的NGS/3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助,同时也对structural variation的理解有益。
  J, R* C" f# Z) g9 v( I: T! z
+ w5 l" J  Y. s3 c1 k- r: W. D2 K8 s事实上在“拔河”比赛中,至少对于protein,无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中,加州的研究人员一直处于前列,例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力,对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助,特别是对于临床,例如Cancer Genomics。! q7 ^: h3 K2 F  G( `$ x
; ~# j! g8 W5 F5 r" j- d
某种意义上来说,“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程,看看等忙完手边儿的一些项目,有时间写个“搭积木”的姊妹篇,“我和春天有个约会”,哦!是和胖胖蛋白有个约会。
  • TA的每日心情
    开心
    2025-3-30 11:48
  • 签到天数: 1064 天

    [LV.10]大乘

    沙发
    发表于 2012-9-15 16:37:48 | 只看该作者
    有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

    该用户从未签到

    板凳
     楼主| 发表于 2012-9-15 20:47:07 | 只看该作者
    本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
    & s/ z& A+ x  T: T
    martian 发表于 2012-9-15 02:37 ( q. [) p7 @( {" M) m( X0 d+ [
    有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
      W. e/ _3 s) @" R1 h! v
    0 d" U/ `1 ^) o! a4 m
    Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm$ y, P2 Z8 l7 W3 t' \& t0 h: [0 y: W

    ; ]* b/ [  c: A1 SMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html$ A2 Y/ f; A" x" K* ^) T# g0 `  n9 z
    这个似乎全文是免费的。
    / a" _) [; }6 G0 Y
    # i0 k6 ~' f8 d) `3 |- \( }2 eBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
  • TA的每日心情
    开心
    2016-2-18 04:19
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    [LV.1]炼气

    地板
    发表于 2012-9-25 16:05:25 | 只看该作者
    有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
      ]. r; `  L& F( F! P, g) U# q6 q不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?2 f% e7 l8 z8 Z2 r
    9 @, H) D7 G& X, S: s7 h
    ; a3 g: D2 n& a, n  P; p) n$ f

    该用户从未签到

    5#
     楼主| 发表于 2012-9-27 11:53:22 | 只看该作者
    隧道 发表于 2012-9-25 02:05 % C8 n9 b5 ?* s* I0 p+ D
    有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
    " t% h4 \2 ~: |& Q7 U/ N不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    , }$ ?% v: q( l+ G
    看着还行,开始出来的东西,不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗?( c6 i+ E9 z& Z
    . e, X! G# f0 \/ z7 Z+ {
    慢慢来,至少部分的能够得到一些3D的信息了,现在的HT技术还做不到。

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