基于“拔河”的HT Chip

喜欢喝冰茶

( p" ]2 s7 H  r& M
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。

事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。

5 [0 s; L) S. P# D某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

喜欢喝冰茶

  k9 H$ p  V4 C! S. Q

martian 发表于 2012-9-15 02:37
; }0 f& f8 ?. y3 ]) H+ x4 Q有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
% m+ z) J$ ]- e  D
Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
* Z# u7 @" H& u& F& L" Q. b" V6 u这个似乎全文是免费的。
+ v  r, u% O- _+ `1 S
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

; V! T  G% }( @( ]# T) p9 H: P
, I! o7 l: ^2 `: k* J+ \+ a  Y/ o

喜欢喝冰茶

隧道 发表于 2012-9-25 02:05
: _% L- c& |; r; T有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

) h- O0 Q" |# O  @! U! c7 C" K1 M看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
* m, Q7 D# P/ e
慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。