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[科技前沿] 基于“拔河”的HT Chip

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楼主
发表于 2012-9-14 22:55:13 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑   e% }. g% g" n1 O

. c2 I+ v# N, N最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度,是现在热炒的NGS/3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助,同时也对structural variation的理解有益。
7 p9 N/ p' |1 F8 ~  {: G$ b* e
" U$ r6 H  L0 M# G9 a9 L; n9 \5 o事实上在“拔河”比赛中,至少对于protein,无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中,加州的研究人员一直处于前列,例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力,对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助,特别是对于临床,例如Cancer Genomics。
/ S4 q5 X" w/ g8 S( k# B6 ^, k
$ O1 v/ ^7 z5 s8 S. m0 J" G: B, h某种意义上来说,“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程,看看等忙完手边儿的一些项目,有时间写个“搭积木”的姊妹篇,“我和春天有个约会”,哦!是和胖胖蛋白有个约会。
  • TA的每日心情
    开心
    5 天前
  • 签到天数: 1064 天

    [LV.10]大乘

    沙发
    发表于 2012-9-15 16:37:48 | 只看该作者
    有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

    该用户从未签到

    板凳
     楼主| 发表于 2012-9-15 20:47:07 | 只看该作者
    本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
    4 |3 [0 P% N/ k8 y  |
    martian 发表于 2012-9-15 02:37
    0 @8 Y/ p8 p$ ~有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

    * S% [) K, P, V/ Y9 A6 N$ r4 G5 b5 A' S2 a
    Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
    ' h# r' r) x2 G, n' D1 C( _. U" z* v  Y1 x7 i- Z
    Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html9 I, W3 n9 h! r3 k) o
    这个似乎全文是免费的。
    8 u. b" o0 ?  W# J' f0 D# l* D9 Q- A, M1 {3 }
    Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
  • TA的每日心情
    开心
    2016-2-18 04:19
  • 签到天数: 1 天

    [LV.1]炼气

    地板
    发表于 2012-9-25 16:05:25 | 只看该作者
    有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。' Z& w2 y' R; b/ T+ d4 D
    不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    7 U: h9 N  ]4 x2 X, _  w4 f: q* W; P  r( G( s
    9 P1 G. Z. j: z, W4 ~& s# Y

    该用户从未签到

    5#
     楼主| 发表于 2012-9-27 11:53:22 | 只看该作者
    隧道 发表于 2012-9-25 02:05 ) }1 K3 K3 s; t, Z
    有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。2 `9 q( P' e- }& {; ]$ i% ?7 \5 B
    不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    ! ^8 [) G( C$ c$ Q, j: s
    看着还行,开始出来的东西,不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗?6 c. j* b% C; J0 b5 k

    5 b% v) q, R4 @8 z7 I% R慢慢来,至少部分的能够得到一些3D的信息了,现在的HT技术还做不到。

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