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[科技前沿] NIH再次设立funding支持新一代纳米技术的测序研究

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发表于 2012-9-20 05:04:10 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-19 22:33 编辑
1 ~7 K, r$ r" y* v; n9 s' j1 A" k  g6 P
NIH/NHGRI准备出19Million去支持nano技术来降低NGS/3GS,maybe 4GS。
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& l( z; `8 i5 c: G* s$ B8 _. F* Dhttp://www.bioresearchonline.com ... amp;source=nl:35056
+ V# j- y2 E. F" f. J. I0 b; B1 e7 Z+ T8 Q2 R$ C
现NIH director好像是原来的NHGRI的director,同时也是Human Genome Project,一个所谓的international collaborative project的leader。- }2 z  F( N2 h. x, Z: o
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& c4 @; h3 i( Y4 l9 [$ n# ^3 m+ D
3 G; Y5 U# o  Z6 f; q: g  u9 `Sequencing的成本在最近的四、五年中,绝对是dramatically的下降。在可以预见的将来,personal genome已经不再是梦想,而且将其发展为新生儿的标准检测之一也并非不可能。事实上,现在10k左右的价格,对癌症病人的医疗开销相比而言也不算什么。这个潜在市场的效益应该还是不小的,不知道会不会使美国health care方面的开支在GDP的比例从1/5变成一个quarter。2 O* O8 d- `% G* t7 [! }. f
) y- y9 o1 T( \8 y; T. k5 h9 f) g! F
至于用处,在没有足够clinical patients' genomes的情况下,molecular diagnosis的全面使用还不是很靠谱,毕竟microarray探测不出新的东西,虽然深度分析加上对现有知识的总结能够发现一些东西。换句话说,FDA/NIH极力推动的personalized medicine还有很大的挑战。但即使如此,这方面的研究已经对癌症的诊断有了贡献。像breast cancer中的几个重要的biomarkers,还有就是几乎成为每次必讲的Nicholas Volker(US clinics quietly embrace whole-genome sequencing),都已经显示出来这个方面的研究潜在的巨大应用前景。而癌症的早期发现,对于治疗有决定性的作用,像breast cancer和prostate cancer的早期发现的治癒率或者控制率几乎将近80%,而到晚期,基本上就靠人品了。 ! q! I/ T5 b" s/ r/ k  X% q2 j

0 z, g" w! ~8 r3 ^" b3 B在令人沮丧的Pathway Genomics-Walgreen-FDA事件(http://www.cnn.com/2010/HEALTH/05/12/genetic.testing.walgreens/)两年后,上个月初,这个领域的著名公司之一,23&Me向FDA递交了510(k)(https://www.23andme.com/about/press/fda_application/)去推动FDA在这个领域的regulation的制定,照23&Me的说法,这是工业界第一次推动政府监管机构制定相关准则的尝试。
0 Y. y: \3 F/ s! B) p6 h( V  C# R7 R+ P8 l! q7 `9 i- h# @% x
当然,这项工作涉及到的不仅是技术上的问题,还有法律,政府监管和医学道德的问题,有很多地方都没有明确的规章制度,虽然早在08年的时候,国会就已经通过了GINA(the Genetic Information Nondiscrimination Act)法案。在国内,SFDA也没有统一的规章制度,据说各地的SFDA拥有相对大的灵活性,事实上,已经有一些海归背景的公司和机构在搞这类东西,但无论是资金还是技术力量和美国还有很大的差距。有意思的是,在这个领域比较兴盛的地方,基本上就是boston地区和南/北加地区,特别是北加地区的公司大部分都集中于硅谷,和google等等为邻。
3 t& M$ `) K, a( G! J8 `0 a  `# j5 k
在众多的NGS/3GS公司中,Complete genomics以提供一个完整solution成为亮点之一。其特别的技术以及深度的分析,至少现在对临床方面会是一个比较好的选择。当然如果成本能更快的降低,加上拥有中国中央和地方政府支持的BGI的强力跟进,希望市场上不再是Life旗下的PGM如日中天的声势。BGI的加入,是否会和Hitachi有千丝万缕关系的life在这行形成所谓的中日之争,我们将拭目以待。
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