NIH再次设立funding支持新一代纳米技术的测序研究

喜欢喝冰茶

4 T: H1 \' Q, |% y, G. V# Y+ l
NIH/NHGRI准备出19Million去支持nano技术来降低NGS／3GS，maybe 4GS。

http://www.bioresearchonline.com ... amp;source=nl:35056
" t9 u% L9 o# w) K8 b& W3 V
; ^, ]& P+ E3 J7 o8 _现NIH director好像是原来的NHGRI的director，同时也是Human Genome Project，一个所谓的international collaborative project的leader。
5 }9 B2 |& \/ x, A( r


Sequencing的成本在最近的四、五年中，绝对是dramatically的下降。在可以预见的将来，personal genome已经不再是梦想，而且将其发展为新生儿的标准检测之一也并非不可能。事实上，现在10k左右的价格，对癌症病人的医疗开销相比而言也不算什么。这个潜在市场的效益应该还是不小的，不知道会不会使美国health care方面的开支在GDP的比例从1／5变成一个quarter。
/ A! |5 ~: I7 c- M9 L" W
; w( k' E! I8 n' K+ s至于用处，在没有足够clinical patients' genomes的情况下，molecular diagnosis的全面使用还不是很靠谱，毕竟microarray探测不出新的东西，虽然深度分析加上对现有知识的总结能够发现一些东西。换句话说，FDA／NIH极力推动的personalized medicine还有很大的挑战。但即使如此，这方面的研究已经对癌症的诊断有了贡献。像breast cancer中的几个重要的biomarkers，还有就是几乎成为每次必讲的Nicholas Volker（US clinics quietly embrace whole-genome sequencing），都已经显示出来这个方面的研究潜在的巨大应用前景。而癌症的早期发现，对于治疗有决定性的作用，像breast cancer和prostate cancer的早期发现的治癒率或者控制率几乎将近80％，而到晚期，基本上就靠人品了。

4 H! Z4 y$ D% \5 h% Z0 V- ^在令人沮丧的Pathway Genomics－Walgreen－FDA事件（http://www.cnn.com/2010/HEALTH/05/12/genetic.testing.walgreens/）两年后，上个月初，这个领域的著名公司之一，23&Me向FDA递交了510（k）（https://www.23andme.com/about/press/fda_application/）去推动FDA在这个领域的regulation的制定，照23&Me的说法，这是工业界第一次推动政府监管机构制定相关准则的尝试。

0 C* }. b. x  K' F2 p当然，这项工作涉及到的不仅是技术上的问题，还有法律，政府监管和医学道德的问题，有很多地方都没有明确的规章制度，虽然早在08年的时候，国会就已经通过了GINA（the Genetic Information Nondiscrimination Act）法案。在国内，SFDA也没有统一的规章制度，据说各地的SFDA拥有相对大的灵活性，事实上，已经有一些海归背景的公司和机构在搞这类东西，但无论是资金还是技术力量和美国还有很大的差距。有意思的是，在这个领域比较兴盛的地方，基本上就是boston地区和南／北加地区，特别是北加地区的公司大部分都集中于硅谷，和google等等为邻。

  O4 q. a% @+ [- |5 H1 i- |/ h在众多的NGS／3GS公司中，Complete genomics以提供一个完整solution成为亮点之一。其特别的技术以及深度的分析，至少现在对临床方面会是一个比较好的选择。当然如果成本能更快的降低，加上拥有中国中央和地方政府支持的BGI的强力跟进，希望市场上不再是Life旗下的PGM如日中天的声势。BGI的加入，是否会和Hitachi有千丝万缕关系的life在这行形成所谓的中日之争，我们将拭目以待。
" m# m( S; [  U; G0 ^