基于“拔河”的HT Chip

喜欢喝冰茶

; {2 ?! p/ i, k; \, O
9 y7 e) x' G# I8 C  \0 |) t! l最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。

  e5 }: R8 n, _+ y% l" C0 M% ]$ N事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。

& l* P. O9 k& c1 d某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

喜欢喝冰茶

martian 发表于 2012-9-15 02:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

# G( X5 q! e' F# c0 @, T8 i& G
3 U5 m8 ?" ~; q8 B, H( _( cMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm

Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
这个似乎全文是免费的。

Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
8 K. ^! h: f% Y, `- Y不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

# e0 B0 W4 u# \0 v! i1 K
# D3 `: B& |, \( `7 c/ w

喜欢喝冰茶

隧道 发表于 2012-9-25 02:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
4 c' U* S9 i: H2 b, W- n不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
+ G) `( r3 L$ l: u. m4 a8 g
$ z+ `) i6 {2 y" B$ ~慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。