基于“拔河”的HT Chip

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' G' f! A, c* ~" l. c" t
! C4 i: A$ X6 _& u# c最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。

事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。

9 n2 z1 g. j7 l) R) \9 E某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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martian 发表于 2012-9-15 02:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

4 n* u0 a. y+ R3 Y, z- K0 d2 t7 N2 m
Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
9 N* L$ w$ P4 L- R- k. \
Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
) r1 a/ V/ R  p1 F5 _- t$ N' t这个似乎全文是免费的。
, d  K( _* U/ |0 r% {
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
- r3 V5 Q* Q4 f+ Q( N不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

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) u3 H. C2 O5 g# f( X

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隧道 发表于 2012-9-25 02:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

. S6 o/ z( A2 @  |! O; G看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？

' U7 H: ]# ~/ R8 @6 h& N慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。