该用户从未签到
straw 发表于 2015-7-15 21:01 我已经脱离这个行当满久了, 不知道现在的情况. 不知道你们需要超算是进行哪一步,图像识别这一步我不了解 ...
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[LV.10]大乘
喜欢喝冰茶 发表于 2015-7-16 10:05 该不是D.E.Shaw开发的那个可以直接硬件算氢键的用于MD Simulation的玩意儿吧。那东西确实挺快,不过用的 ...
冰蚁 发表于 2015-7-16 09:17 好象是那个。我的意思是能不能借鉴那个思路,发展专用计算工具(包括数据专用存储格式之类),也许做几个 ...
喜欢喝冰茶 发表于 2015-7-16 10:36 计算工具和文件格式都是专用的,不像一般的超算,用的商用云计算pipeline是可以编程的,它将cluster上的j ...
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[LV.9]渡劫
喜欢喝冰茶 发表于 2015-7-16 23:10 文件大不假,连续数据读写不应该算多。这个问题不是硬盘快不快的问题,而是算法的问题,那玩意是个NP com ...
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[LV.7]分神
水风 发表于 2015-7-17 05:08 一看就是算法问题。商业的云计算根本就不是干这个的。你们不知道也就罢了,你们头不知道就是个奇葩了。 ...
eshark 发表于 2015-7-16 23:11 除非你的内存可以一次性load所有数据,并且中间结果也能在内存里hold住,否则一般优化后台存储可以提高30 ...
喜欢喝冰茶 发表于 2015-7-17 22:21 商业云计算只是提供个平台而已,并不都是AWS模式。专用的云计算平台多了去了,而且都是针对性的。算法问 ...
水风 发表于 2015-7-17 13:03 我当年跟人合作过,不过我们那个时候没有这么牛,做不到全基因组。就测了一条最短的染色体的长臂。 我不 ...
喜欢喝冰茶 发表于 2015-7-18 05:21 不知道您当时用的什么方式,sanger?08年那会儿NGS是还不很完善,无论是实验还是计算部分。所以那会儿也 ...
水风 发表于 2015-7-17 20:18 是自动测序仪,应该是sanger原理的。当时还没有上市的型号,我老板人头熟,公司送给我们免费试用的。当时 ...
喜欢喝冰茶 发表于 2015-7-18 12:39 严格意义上,第二代大规模以荧光为基础的测序仪都可以说是sanger原理的,问题是有多深,有多快,准确率如 ...
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冰蚁 发表于 2015-8-4 00:45 建议写科普文吧~~~
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