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标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 : Q/ [1 L% `6 y
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最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。0 e0 s' |' _, p) q# J: \: l
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事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
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$ E0 o1 s% a0 U某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
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martian 发表于 2012-9-15 02:37 ; S1 C( s$ d/ A+ P. U' x
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

2 n1 d! y0 h! X1 e; n; k8 ~5 e0 b- g8 t" |
Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
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7 j7 J, p' z3 m4 V) XMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html. l+ z; j# t- Q, `. }" {2 [
这个似乎全文是免费的。
* N6 u3 v- z8 f/ l$ f9 k, A7 A) Y# V3 J0 l6 W% v
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
" x1 {7 r' D5 w' q- l9 ?4 c4 K不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？' ?+ l6 O' f0 Y" f! L% K
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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05 * [4 r+ f, P6 p' Q1 G( y6 K' x/ a3 Y& }* ~
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。% N& i3 W) C3 T* Z, [6 `
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
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! _  @& ?% Z7 O/ K7 }: k5 x5 o  I1 p慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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