爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 * y# c0 A5 x0 F2 p% b/ N( S$ }

- G; `- I- R* ^( J# B- X最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。1 r: [! l& Z! ]4 N7 g0 Q$ u

/ a1 e! t3 h1 `- \! e事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
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某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 0 _/ e7 X( |& U; E
martian 发表于 2012-9-15 02:37
0 z9 f/ m; I2 h4 `  i有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
& B$ m8 P) \8 ?. L4 l7 Z9 }' A  s

$ M9 p2 w% k6 L" ^! a0 Y6 R+ B  ZMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm- I6 U% q% m* d/ L

  X# c. \2 W3 L& }4 j7 w5 H+ LMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html( L5 u8 f# [: g3 K0 C
这个似乎全文是免费的。4 R5 S6 P3 v9 a& p9 l( W
$ a' y; n2 G* x5 b
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
0 ~" c" {7 m0 G* u不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
5 m5 x, L: C  Y9 R3 D" g
: H+ z9 n" _6 ], o
0 y& o. f  Q" r( t$ P( s5 ^& g
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05 5 M8 B' W; U/ C) `3 `9 n
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
& U4 I8 D5 O" j  L' t0 n3 Z不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
: ^. n, n- ]5 h  X
看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？* F. s/ O, }' s  A

4 H* `5 f% B, M6 C( g& ]: Q, g2 u慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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