爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑
( H: a( s# S' H3 V3 ]. P8 G- ]0 C- l0 R& k+ [/ ^  a3 d8 C8 n
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。4 y% R0 U# s# t+ _% f) \
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事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。! p& U8 P# E" ~' b

; Z0 t8 x- t# V1 @3 M; a2 `6 C5 h某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 * X/ |( |' r9 e, R8 F
martian 发表于 2012-9-15 02:37
6 h! S) l/ b$ B3 o1 W9 l2 D7 w有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
, D9 I; @  M. _" _' H# v5 ?

2 k6 j8 u  A: YMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
4 W" z- a2 L: D) k: C
6 Y: J8 t5 y9 q" N( dMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html% l4 T) G% t8 G! ^6 `3 h( w
这个似乎全文是免费的。
2 f% v6 v/ i) Q9 O4 }  _
( {$ N/ k3 ~- m, B, s3 E$ lBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
3 w+ {0 @9 B7 w不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05 + D, l: v; E5 }3 j0 U
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
) i" f% [1 ]2 R* j: |' N不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？: |: K0 n8 O1 c8 z
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慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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