爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 8 B( r8 L, [' Q  K

2 n. p% S) N# y4 {/ R% @最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。" g4 w3 w  h+ M* l
' Z& H7 S5 m% J/ H$ d! c
事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。! M5 K. A! i3 i) u- z6 N( L

- }( c2 x' M4 ~0 {8 N3 z某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 $ j" u% Y5 X6 e8 y
martian 发表于 2012-9-15 02:37
7 [; X0 \8 I& {7 o8 N# p' t% L有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
1 T9 {) Y# s) ^+ K# I2 o' I
( v* P- o# J- D3 U8 j1 W
Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm' C" C9 ~* E% q. J. Q

  |- {. @" E, ^4 |" pMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html" r7 \7 t6 G9 {5 ]3 m
这个似乎全文是免费的。
* ]/ J( j/ N* F9 X, x. l9 ~% i( [6 E+ ~1 I4 ]2 d2 J4 }
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
. F# Z0 ?& C5 U0 R/ D. w  {不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？" |9 {, V: p1 ?2 l' t. c8 m

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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05
; ^; n/ x) w+ a0 e$ g有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。1 r  ?; S% j% P" V& T7 c3 W
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

. ?( i/ v" K/ q1 s看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
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! V; G  ~; s; S( T0 O慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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