爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]

作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 & i3 }5 m" F. A+ i2 ]4 B* Q+ \$ N
+ [' n! c; o& e; M0 N
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度,是现在热炒的NGS/3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助,同时也对structural variation的理解有益。! Q. i* h  m( ^' U* {, f5 Y

( Z, A) A5 Z1 {- k% b4 i事实上在“拔河”比赛中,至少对于protein,无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中,加州的研究人员一直处于前列,例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力,对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助,特别是对于临床,例如Cancer Genomics。
0 B$ ]4 A2 c6 V- a  M6 s6 e' Z% e# ^5 e+ z: v) B6 ]- m7 I  S
某种意义上来说,“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程,看看等忙完手边儿的一些项目,有时间写个“搭积木”的姊妹篇,“我和春天有个约会”,哦!是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 ( u) R, D9 A+ L1 C! D
martian 发表于 2012-9-15 02:37
$ H' a$ q. n2 Q% B/ E' |有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

2 N5 @9 e, ]+ _. ?9 B) Q& ?) x9 a7 [# w( E
Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
& c8 P$ t. k. c/ Q( u4 K. w
+ |/ d8 e: w. D3 ?% uMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
( \  a9 y- t3 k这个似乎全文是免费的。: o- L1 z1 W8 Q$ J6 P! A- |& u4 Z
5 f( a% @  V8 j2 u. f) {: r$ p
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。: I3 ?' `' L3 y( q6 ?
不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
' C7 S" o% |0 m3 `$ {9 G
0 f2 [: ]" k1 W5 u9 h% h5 J& l3 p* \

作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05
. m' _0 P. ~2 l9 F, E有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。2 _# z- p5 w# S' t" k* ^  W) @
不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
2 `. ]. m: e2 t$ s8 H
看着还行,开始出来的东西,不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗?
9 t8 r9 e& I/ J$ k$ `5 K, s7 w
慢慢来,至少部分的能够得到一些3D的信息了,现在的HT技术还做不到。




欢迎光临 爱吱声 (http://129.226.69.186/bbs/) Powered by Discuz! X3.2