爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 / ~3 q7 }0 z' G
, C7 ~3 A" T/ f/ S2 ]( a2 T
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
) R' X6 K  C, c" R8 z: q% X8 S; O0 Y9 \
, g, V4 r6 b% \- R6 D- W3 |事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。, I% s, ~; [. u# K$ e

  i* i% h9 m5 S! F某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 5 L0 {% ^5 c$ J3 Q4 f7 b, Y
martian 发表于 2012-9-15 02:37 4 d: h0 t( L; V9 X* l+ S
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

& c! [8 {1 n9 ?0 P: o  S8 H
  m$ c& o- {4 P& L( qMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
3 [* q4 Y# v% f4 n9 B! p& P% _) K
Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
9 P( g( t  o" \+ _* F+ h这个似乎全文是免费的。
- A- i0 {' D/ u
% t. d; u1 ^; X* ^* p2 m0 K1 b7 N- RBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。- Q: o  W! _0 P- v6 L* v* o+ d; X
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
8 \! u8 s& j# o4 _9 K7 i5 I* w0 o
* I" Y1 g7 M+ z5 N8 k  X& X1 D( v3 O# x, b5 X: ?; m- i+ a
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05   f9 J* z) ]+ c4 Y
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
7 f0 o8 B; f' A" a, S3 q不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

# `2 z7 G, s9 L1 a" n$ i看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
" k1 ~8 f2 h* Z" [# }2 N2 _$ d6 F5 ~$ h! v! p* H+ g
慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



欢迎光临 爱吱声 (http://129.226.69.186/bbs/) Powered by Discuz! X3.2